天津市河西区疾病预防控制中心关于2024年国家致病菌识别网基因测序服务采购项目

序号

采购类别

采购项目名称

时间

预算金额（元）

具体要求

备注

*

服务

****年国家致病菌识别网基因测序服务招标

全年

******

*、全基因组测序： ★（*）检测内容：******检测，组装出样本的目的菌株的基因组框架图（.fasta文件）及符合致病菌识别网最新要求的加密格式（.cpin文件）。 （*）检测方法：使用*代高通量测序，对样本采用常规******深度***X，测序类型PE的测序方法，******测******De N******分析流程。 （*）样本类型：包括但不限于菌悬液、培养平板、瓷株保存管等； （*）检测交付：下机数据能满足上传国家致病菌识别网的数据需求，并协助客户成功将数据数据上传致病菌识别网相关模块；对于检测结果不合格的样品，服务商需免费加测直至成功；应在天津本地完成，且实验室应具有生物安全资质，不得转运其他省市。 ★（*）数据交付：包括但不限于：检测报告、单端fastq文件、框架图fasta文件、加密格式cpin文件、基因功能注释分析、CADB分析、PHI数据库分析、CAZy数据库分析、VFDB数据库分析、参考序列比对等；并可根据致病菌识别网要求******分子血清分型及毒力基因的定制化分析流程，包括但不限于沙门菌MLST分析及分子血清分型、肺炎克雷伯菌分子分型、肺炎链球菌型别等定制化分析流程； （*）检测周期：从收取样本到结果发出的时间≤**工作日； （*）采用*代基因测序仪、分析软件； （*）有自主开发的微生物组装及耐药毒力分析自动化分析系统等； ★（*）投标人应具备专业的现场技术支持******，提供服务包******理及运输、数据下载及上传、******过程中遇到的各种问题；投标人应承诺能提供的免费现场技术服务次数≥*次/周。 （**）单个样本下机数据量不低于*G base； （**）生信分析：提供专业生******理数据分析过程中遇到的问题，包括但不限于生信分析结果的解释与数据上传等，保障客户数据可以成功上传致病菌识别网。 *、宏基因组测序 ★（*）检测内容：基******检测，测定样本中存在的可疑致病微生物； （*）检测方法：根据宏基因组学方法学原理（metagenomics NGS, mNGS），采用常规文库构建流程，利用高通量测序法，******测序，再通过微******比对分析，经过智能化算法获得疑似致病微生物的种属信息，并提供全面深入的报告参数辅助临床诊疗决策； （*）样本类型：包括但不限于血、脑脊液、肺泡灌洗液、痰液、体液、组织等多种样本类型； ★（*）检测交付：下机数据能满足上传国家致病菌识别网的数据需求，并协助客户成功将数据数据上传致病菌识别网相关模块；对于检测结果不合格的样品，服务商需免费加测直至成功；应在天津本地完成，且实验室应具有相应生物安全资质，不得转运其他省市。 ★（*）检测周期：从收取样本到报告发出时******检测交付； （*）采用*代基因测序仪、分析软件； （*）具有自主开发的病原体数据库，病原种类覆盖*****种以上，包括病毒、细菌、真菌、寄生虫等；具备检测相关的耐药、毒力基因的能力； ★（*）投标人应具备专业的现场技术支持******，提供服务包******理及运输、数据下载及上传、******过程中遇到的各种问题；投标人应承诺能提供的免费现场技术服务次数≥*次/周。 （*）测序数据量特异性序列片段数不低于**M reads，针对不同样本类型：单份粪便/肛拭子/脑脊液样品测序reads数目在**M或以上，肺泡灌洗液/血液样品测序reads数目在**M或以上，痰液/咽拭子样品测序reads数目在**M或以上； （**）数据录入：提供专业生******理数据分析过程中遇到的问题，包括但不限于生信分析结果的解释与数据上传等，保障客户数据可以成功上传致病菌识别网。

*方机构负责取走样本

合计

******